Volcar clonado ssd

Hola, he clonado mi ssd usando un software llamado AOMEI. Lo he clonado a un disco externo. El disco original está formateado y ahora he clonado el disco externo al disco original, pero windows no arranca. Están todas las particiones originales y tengo acceso a los datos, pero lo que necesito es restablecer el pc conforme estaba por los programas que tenía instalados.